Перші монахи у лаврі з'явилися ще у VIII столітті, але кілька століть поспіль церква страждала від грабіжників та мародерів. А найбільше святиня зазнала шкоди за радянських часів - тут у різний період були кінотеатр, санаторій та навіть музей атеїзму. Після цього печери і храм святителя Миколая на крейдовій скелі були в аварійному стані, а тому закриті для людей.

Чернече життя в обителі відновили лише у 1992 році й почали активно відбудовувати монастир. Вранці тут провели урочисту службу, а глава УПЦ митрополит Онуфрій привітав усіх вірян.